DEVONthink hat keine eingebauten Backup-Funktionen. Über Ihre persönliche Backup-Strategie entscheiden Sie selbst. Aufgrund der Einfachheit von Apples Time Machine empfehlen wir, sie mit lokalen externen Laufwerken zu verwenden. Für ein Online-Backup können Sie einen Cloud-Backup-Dienst verwenden, der Snapshots sichert und keine kontinuierlichen Backups anfertigt. Arq ist ein solcher Dienst.

Obwohl die Synchronisierung im Notfall zur Wiederherstellung einer Datenbank verwendet werden kann, sollte es nicht Ihre einzige Datensicherung sein. Die synchronisierten Daten sind in Stückchen unterteilte DEVONthink-spezifische Rohdaten. Damit sind sie nur für DEVONthink oder DEVONthink To Go lesbar. Ein sinnvolles Backup sollte unabhängig von einem Programm sein.