DEVONthink Pro und Server arbeiten mit jedem Scanner, der mit Apples Image Capture funktioniert (TWAIN unterstützt es nicht). Sie unterstützen außerdem die Integration mit Ricoh ScanSnap-Scannern über die ScanSnap-Manager- und ScanSnap-Home-Software.

Was die OCR betrifft, so verfügen DEVONthink Pro and Server über ein integriertes ABBYY Finereader, um die Texterkennung direkt in DEVONthink durchzuführen. Allerdings unterstützt auch die reguläre Edition von DEVONthink den Import von Dateien, die von Drittanwendungen bereits mit Texterkennung vorbereitet wurden.